В отличие от горных пород, которые абиотичны, почва обладает определенными биологическими свойствами и теснейшим образом связана с деятельностью различных организмов. Верхняя часть почвенного профиля пронизана массой корневых систем, которые, непрерывно отрастая, отмирая и разлагаясь, являются факторами разрыхления и структурообразования почвы и основой для жизни животных и микроорганизмов. Гумусовые горизонты почвы, особенно вблизи корней, содержат большое количество микроорганизмов, исчисляющихся сотнями миллионов и миллиардами в 1 г почвы. Многочисленные насекомые, роющие животные густо населяют почву, перемещают и перемешивают ее массу, являются после отмирания источниками органического вещества и материалом для жизнедеятельности микроорганизмов. Бактерии и грибы, населяющие почву, продуцируют в конечном счете гумусовые вещества, специфические ферменты, антибиотики и иногда токсины. Всего этого не имеют горные породы.